No entiendo.

En el servidor A ¿Instalaste apache y ahí apunta tu DNS para   www.midominio.com? y en el servidor B ¿Instalaste postfix + apache + squirrelmail?

Si es así, no es posible lo que quieres hacer.

Para lograrlo en el servidor A debes instalar apache + squirrelmail y apuntar tu DNS para que resuelva tu dominio hacía este servidor (A), en el servidor B instalas postfix.

No dices como instalaste squirrelmail, por lo tanto no se donde puedas haberlo puesto en tu sistema de archivos, pero un Alias en httpd.conf te puede lograr la ruta que deseas si es que no pusiste squirrelmail dentro de /var/www/html.