Buen día a todos.
Antes, quiero agradecer a todos lo que me han contestado.
La solución fue agregar las librerías que no encontraba en el archivo profile, de la siguiente forma.
export PATH=$PATH:/usr/lib64/openmpi/bin
LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/lib64:/usr/lib64/openmpi/lib:/usr/lib64/compat-openmpi/lib
export LD_LIBRARY_PATH
-------------------------------------- Librerias que no encontraba ---------------------------------- [root@elrond ~]# g_mdrun_openmpi g_mdrun_openmpi: error while loading shared libraries: libmpi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
g_mdrun_openmpi: error while loading shared libraries: libgmxpreprocess_openmpi.so.6: cannot open shared object file: No such file or directory --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Agradezco nuevamente por sus respuesta y dejo la solución para todas las personas que necesiten solucionar este tipo de problema de librerías con el Gromacs.
Saludos y un gran abrazo para todos
El 23 de mayo de 2012 10:12, Luciano Andrés Chiarotto <lachiarotto@gmail.com
escribió:
Otra cosa que hice fue configurar la rutas de la bibliotecas, me comento un amigo que podía ser el problema.
Crear un archivo openmpi.conf en el siguiente directorio.
vi /etc/ld.so.conf.d/openmpi.conf
y agregar en ese archivo la siguiente línea.
/usr/lib64/openmpi/lib Guardar y cerrar el archivo y luego ejecutar el siguiente comando.
#ldconfig
Después de todo esto volví a probar y no funcionó. (La reinicie completa pero sigue todo igual).
Saludos y desde ya muchas gracias por su aporte. Espero que esto también les pueda servir a otra persona a resolver otros problemas.
Luciano
El 22 de mayo de 2012 16:01, Luciano Andrés Chiarotto < lachiarotto@gmail.com> escribió:
Hola Eduardo y a toda la comunidad.
Gracias por tu respuesta pero sigue el mismo mensaje.
[root@elrond ~]# g_mdrun_openmpi g_mdrun_openmpi: error while loading shared libraries: libmpi.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory [root@elrond ~]#
Busqué esa librería y se encuentra en la siguiente dirección.
[root@elrond ~]# find / -iname libmpi.so.0 /usr/lib64/compat-openmpi/lib/libmpi.so.0 [root@elrond ~]#
Si alguien tiene otra sugerencia se los voy agradecer.
Desde ya muchas gracias.
El 19 de mayo de 2012 20:56, Eduardo Grosclaude < eduardo.grosclaude@gmail.com> escribió:
2012/5/16 Luciano Andrés Chiarotto lachiarotto@gmail.com:
Hola a todos.
La solución a medias que encontre en las páginas que me pasaron fue la siguiente.
- -Agregar en el " /etc/profile " la siguientes líneas
LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/lib64/openmpi/lib
export $LD_LIBRARY_PATH
Debería ser export LD_LIBRARY_PATH
-- Eduardo Grosclaude Universidad Nacional del Comahue Neuquen, Argentina _______________________________________________ CentOS-es mailing list CentOS-es@centos.org http://lists.centos.org/mailman/listinfo/centos-es
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Luciano Andrés Chiarotto