no estos muy familiarizado con centos pero esto es lo que tengo de espacio [root@mail ~]# du -sh /home 185M /home [root@mail ~]# df -h S.ficheros Tamaño Usado Disp Uso% Montado en /dev/hda5 2,9G 2,8G 0 100% / /dev/hda6 1,9G 36M 1,8G 2% /tmp /dev/hda3 31G 2,1G 27G 8% /var /dev/hda2 34G 361M 32G 2% /home /dev/hda1 2,9G 80M 2,7G 3% /boot tmpfs 473M 0 473M 0% /dev/shm [root@mail ~]# Hola creo que no tienes el espacio suficiente en tu partición / para instalar las actualizaciones, al final de todas las lineas tienes esto needs 5MB on the / filesystem hazle un df -h y mira que cantidad de espacio tienes en tu partición /, creo que tienes que ver en donde esta el consumo excesivo de espacio si tienes usuarios en home corre este comando du -sh /home y te dirá la cantidad de espacio que tienes el home
No tienes espacio en tu partición / debes liberar espacio, ese esquema que tienes es fatal como se puede asignar 2GB a la partición /